63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4300 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  266  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  69.29 
 
 
129 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  68.5 
 
 
129 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  67.72 
 
 
129 aa  183  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  62.99 
 
 
128 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  62.99 
 
 
128 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  61.07 
 
 
132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  60.8 
 
 
129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  61.42 
 
 
128 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  61.42 
 
 
128 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  58.59 
 
 
128 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  63.78 
 
 
136 aa  167  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  60.63 
 
 
128 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  59.38 
 
 
132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  59.38 
 
 
132 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  56.69 
 
 
128 aa  159  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  56.25 
 
 
128 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  56.69 
 
 
129 aa  158  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  55.91 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  57.81 
 
 
132 aa  157  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  58.59 
 
 
132 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  59.23 
 
 
132 aa  155  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  58.46 
 
 
132 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  57.81 
 
 
132 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  57.81 
 
 
132 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  52.55 
 
 
149 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  57.81 
 
 
132 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  29.51 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  34.62 
 
 
120 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  33.05 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  28.33 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  34.38 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  31.15 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  31.36 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0416  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0478  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  29.46 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1197  protein of unknown function DUF488  30.65 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.800748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  24.58 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.97 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  30.08 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0289  hypothetical protein  26.45 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0136906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  30.51 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  26.23 
 
 
115 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  24.6 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0798  protein of unknown function DUF488  36.08 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000164638  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0239  protein of unknown function DUF488  26.89 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  30.08 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3431  hypothetical protein  27.42 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00932776  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  29.75 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0032  protein of unknown function DUF488  30.43 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.333631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  28.69 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  27.19 
 
 
123 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  25 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  30.84 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>