65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4121 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  87.79 
 
 		 132 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  76.34 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  70 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  70 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  70 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  70 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  70 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  69.23 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  68.7 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  65.38 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  65.91 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  64.89 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  65.38 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  64.62 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  65.91 
 
 		 132 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  60.14 
 
 		 149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  63.36 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  60.31 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  65.65 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  62.31 
 
 		 128 aa  167  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  62.6 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  64.89 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  57.58 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  64.12 
 
 		 128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  64.89 
 
 		 136 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  56.49 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  60.31 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  58.46 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  56.15 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  31.71 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  30.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  27.64 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  29.92 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.4 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  27.91 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  25.41 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  29.69 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  31.01 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  27.34 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  26.56 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0871  hypothetical protein  26.83 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0222  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  26.13 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  26.98 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2090  hypothetical protein  28.8 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0228  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0416  hypothetical protein  29.27 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318047  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0478  hypothetical protein  29.27 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  24.41 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  28.46 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  24.59 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  29.6 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  28 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  29.52 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3152  hypothetical protein  30.08 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.919699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1515  protein of unknown function DUF488  27.97 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.933464  normal  0.210794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  24.59 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  29.75 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  32.23 
 
 		 123 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>