56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2232 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  268  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  70.4 
 
 		 129 aa  197  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  70.45 
 
 		 132 aa  196  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  69.29 
 
 		 128 aa  191  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  70.31 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  69.29 
 
 		 132 aa  190  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  67.97 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  66.67 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  65.89 
 
 		 129 aa  186  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  63.31 
 
 		 149 aa  186  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  68.5 
 
 		 132 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  67.72 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  67.72 
 
 		 128 aa  183  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  67.72 
 
 		 132 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  66.14 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  62.12 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  63.78 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  65.35 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  63.78 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  60.16 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  62.99 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  63.78 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  65.12 
 
 		 136 aa  171  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  60.31 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  60.31 
 
 		 132 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  59.2 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  38.46 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  32.18 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  31.76 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0551  protein of unknown function DUF488  35.9 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  32.53 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  32.32 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  28.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  29.27 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  31.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  34.18 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  30.77 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0289  hypothetical protein  30.77 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0136906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  32.54 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  26.05 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  31.36 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  29.67 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  27.64 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  28.1 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>