54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1203 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  173  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  62.99 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  64.84 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  64.06 
 
 
132 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  166  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  167  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  62.5 
 
 
132 aa  166  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  61.42 
 
 
128 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  61.72 
 
 
132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  62.2 
 
 
128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  58.27 
 
 
128 aa  159  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  56.25 
 
 
128 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  60.16 
 
 
132 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  60.16 
 
 
132 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  158  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  59.2 
 
 
129 aa  158  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  56.06 
 
 
132 aa  157  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  157  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  59.38 
 
 
132 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  57.48 
 
 
129 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  55.47 
 
 
149 aa  154  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  56.69 
 
 
128 aa  154  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  56.15 
 
 
132 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  56.15 
 
 
132 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  147  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  56.92 
 
 
132 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  56.69 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  53.6 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0871  hypothetical protein  28.46 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  33.9 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  30.4 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  30.91 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  27.78 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  27.64 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  30.33 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0623  hypothetical protein  34.02 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278191 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  24.59 
 
 
113 aa  42.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  28.91 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  34.48 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  26.02 
 
 
120 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  25.41 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3092  hypothetical protein  35.56 
 
 
120 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2090  hypothetical protein  28.44 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  26.67 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  27.12 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  31.2 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  30.16 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4425  hypothetical protein  27.97 
 
 
123 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.987297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>