60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6003 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  95.42 
 
 
132 aa  256  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  253  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  253  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  91.6 
 
 
132 aa  248  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  87.02 
 
 
132 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  86.26 
 
 
132 aa  230  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  76.38 
 
 
129 aa  208  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  74.8 
 
 
129 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  73.23 
 
 
128 aa  204  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  74.02 
 
 
129 aa  204  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  73.23 
 
 
128 aa  194  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  70.87 
 
 
128 aa  193  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  65.91 
 
 
132 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  65.91 
 
 
132 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  67.69 
 
 
132 aa  183  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  65.35 
 
 
129 aa  179  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  64.06 
 
 
128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  63.78 
 
 
128 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  60.58 
 
 
149 aa  166  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  59.54 
 
 
132 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  64.57 
 
 
136 aa  165  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  62.2 
 
 
129 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  62.2 
 
 
128 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  58.27 
 
 
129 aa  163  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  62.2 
 
 
129 aa  163  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  60.63 
 
 
128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  59.38 
 
 
128 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  58.27 
 
 
128 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  57.81 
 
 
128 aa  157  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  30.33 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  28.1 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  35.29 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  26.36 
 
 
171 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  30 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  29.91 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  28.46 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  31.86 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  30.28 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  29.37 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  26.23 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  32.43 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  33.06 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  27.05 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  25.42 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  27.12 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50620  hypothetical protein  29.77 
 
 
157 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0346513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  25.42 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  29.66 
 
 
129 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1369  hypothetical protein  29.03 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.623897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  29.37 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  30.77 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  36.46 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  30.39 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  28.23 
 
 
115 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  28.23 
 
 
115 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>