59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3760 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  99.24 
 
 		 132 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  90.15 
 
 		 132 aa  243  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  87.79 
 
 		 132 aa  233  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  87.02 
 
 		 132 aa  224  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  86.26 
 
 		 132 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  86.26 
 
 		 132 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  78.74 
 
 		 128 aa  216  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  80.31 
 
 		 129 aa  214  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  77.17 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  76.38 
 
 		 129 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  76.38 
 
 		 128 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  72.44 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  68.5 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  67.69 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  65.38 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  65.38 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  64.96 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  67.19 
 
 		 128 aa  176  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  66.14 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  66.14 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  66.93 
 
 		 128 aa  169  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  66.14 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  61.07 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  58.91 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  65.35 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  67.72 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  62.2 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  59.38 
 
 		 128 aa  161  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0106  protein of unknown function DUF488  34.17 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  27.97 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  27.97 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  31.15 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3358  protein of unknown function DUF488  30.77 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  27.12 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  29.51 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1898  hypothetical protein  29.41 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.715816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  26.36 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  32.05 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  32.93 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  29.84 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  29.41 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1901  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.45586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2081  hypothetical protein  29.03 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000626921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  29.37 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3631  hypothetical protein  30.58 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  31.53 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  27.87 
 
 		 117 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.01 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  30.16 
 
 		 169 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  31.4 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  34.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0440  protein of unknown function DUF488  29.51 
 
 		 114 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>