204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3551 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3551  alpha-glucan phosphorylase  100 
 
 
567 aa  1174    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2105  alpha-glucan phosphorylase  54.44 
 
 
550 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.669842  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3228  alpha-glucan phosphorylase  54.44 
 
 
549 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0235  alpha-glucan phosphorylase  52.34 
 
 
554 aa  582  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.400789 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0308  a-glucan phosphorylase  51.3 
 
 
544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0370  alpha-glucan phosphorylase  45.28 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1452  alpha-glucan phosphorylase  44.91 
 
 
520 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0535  alpha-glucan phosphorylase  44.74 
 
 
520 aa  455  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0467  alpha-glucan phosphorylase  45.28 
 
 
520 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0980  alpha-glucan phosphorylase  43.4 
 
 
519 aa  436  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.490785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  37.64 
 
 
541 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  36.73 
 
 
540 aa  343  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  35.47 
 
 
535 aa  339  9.999999999999999e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  35.52 
 
 
541 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  34.24 
 
 
545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  34.37 
 
 
854 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  33.5 
 
 
854 aa  299  9e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  35.87 
 
 
823 aa  299  9e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  34.41 
 
 
736 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  33.9 
 
 
844 aa  294  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  33.66 
 
 
855 aa  294  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  34.71 
 
 
854 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  33.89 
 
 
690 aa  292  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  32.48 
 
 
854 aa  286  8e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  33.28 
 
 
850 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  32.91 
 
 
703 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  32.57 
 
 
737 aa  283  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  33.06 
 
 
706 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  34.87 
 
 
693 aa  281  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  32.14 
 
 
706 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  33.22 
 
 
850 aa  280  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  32.89 
 
 
848 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  33.83 
 
 
719 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  31.5 
 
 
853 aa  279  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  32.11 
 
 
835 aa  276  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  33.44 
 
 
838 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1805  alpha-glucan phosphorylase  33.27 
 
 
570 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  33.55 
 
 
854 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  31.35 
 
 
850 aa  274  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  32.5 
 
 
722 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  33.06 
 
 
832 aa  273  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  31.57 
 
 
849 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  33.28 
 
 
1421 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  33.55 
 
 
854 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  33.28 
 
 
748 aa  271  2e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  31.63 
 
 
704 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  31.76 
 
 
853 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  31.11 
 
 
855 aa  270  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  34.11 
 
 
847 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  33.22 
 
 
717 aa  268  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  30.62 
 
 
849 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  32.87 
 
 
567 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  32.39 
 
 
712 aa  267  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  31.11 
 
 
703 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  32.25 
 
 
858 aa  266  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  31.9 
 
 
860 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  31.9 
 
 
860 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  31.9 
 
 
860 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  31.19 
 
 
877 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  31.03 
 
 
862 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  30.83 
 
 
705 aa  262  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  30.91 
 
 
849 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  32.9 
 
 
719 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  31.71 
 
 
853 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  31.91 
 
 
842 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  31.77 
 
 
871 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1203  Alpha-glucan phosphorylase  31.96 
 
 
729 aa  256  7e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.775439  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  32.41 
 
 
570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  31.07 
 
 
875 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  31.51 
 
 
881 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  31.11 
 
 
713 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  31.01 
 
 
863 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  33.51 
 
 
563 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3147  alpha-glucan phosphorylase  33.28 
 
 
856 aa  252  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.639175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  33.57 
 
 
538 aa  252  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1098  alpha-glucan phosphorylase  32.43 
 
 
856 aa  251  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.27206  hitchhiker  0.000386148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  31.74 
 
 
863 aa  251  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2997  glycogen phosphorylase  31.84 
 
 
558 aa  250  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00491814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  31.59 
 
 
863 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0912  alpha-glucan phosphorylases  32.06 
 
 
855 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.275297  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  31.82 
 
 
857 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  31.33 
 
 
694 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  31.73 
 
 
855 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  31.61 
 
 
873 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  31.12 
 
 
854 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  30.02 
 
 
872 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  30.55 
 
 
860 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  30.78 
 
 
854 aa  245  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  33.07 
 
 
841 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  33.07 
 
 
841 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  30.71 
 
 
851 aa  243  6e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  30.81 
 
 
849 aa  243  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  30.95 
 
 
716 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  32.52 
 
 
737 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  32.39 
 
 
561 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  32.69 
 
 
854 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  33.39 
 
 
822 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0715  Alpha-glucan phosphorylase  29.76 
 
 
852 aa  238  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1833  alpha-glucan phosphorylase  31.62 
 
 
861 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.199755  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3664  Alpha-glucan phosphorylase  31.33 
 
 
852 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>