142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28250 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28250  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  100 
 
 		 374 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1450  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.39 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2340  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  45.95 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0157  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0245  microcin immunity protein  28.8 
 
 		 344 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0633  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.95 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.2 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.61 
 
 		 331 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  25.42 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  25.87 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  24.31 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  25 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  25 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  25 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  25 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  24.29 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  25.88 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  23.81 
 
 		 333 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.76 
 
 		 305 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.96 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  22.49 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  24.58 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.89 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.42 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.08 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  30.23 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.93 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  27.27 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.3 
 
 		 310 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.22 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.95 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  33.13 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.11 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  22.16 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  22.16 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2055  microcin immunity protein MccF  31.53 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  22.76 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.29 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.82 
 
 		 303 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  21.18 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  41.61 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  20.91 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  20.83 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  21.69 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.35 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.72 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  22.97 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.54 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  22.16 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  21.89 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  20.75 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  22.07 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  20.64 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  22.07 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  21.93 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  20.85 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.07 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.88 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.13 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  29.87 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  20.65 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  21.47 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.59 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.57 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  20.86 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.01 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.07 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  35.56 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.33 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.67 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  33.33 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.58 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  34.4 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  20.22 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.43 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  30.95 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.68 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  27.46 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.71 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.7 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.09 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.09 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.57 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.22 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.43 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.77 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.22 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  32.58 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.78 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  35.38 
 
 		 301 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.46 
 
 		 289 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  22.36 
 
 		 326 aa  53.5  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3337  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.89 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.31 
 
 		 304 aa  53.1  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  24.79 
 
 		 289 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>