141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0633 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0633  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 		 338 aa  698    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0245  microcin immunity protein  34.81 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0157  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.95 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1450  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.52 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2340  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.51 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28250  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  27.39 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.81 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  25.95 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  25.71 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  27.95 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  25.71 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  26.27 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.84 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  27.67 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.49 
 
 		 339 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  27.67 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  27.67 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  28.48 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  27.09 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2777  LD-carboxypeptidase family protein  28.76 
 
 		 289 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  26.61 
 
 		 300 aa  90.1  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  25.38 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.85 
 
 		 329 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  26.11 
 
 		 343 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  25.56 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  25.38 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.76 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  29.03 
 
 		 346 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  24.72 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  24.72 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  25.56 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  25 
 
 		 343 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  25.76 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.77 
 
 		 331 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3191  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.35 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.57 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  26.03 
 
 		 343 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  24.79 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.08 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.23 
 
 		 305 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  28.87 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  28.87 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  25.45 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  28.11 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.94 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  26.04 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.14 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.62 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  22.79 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  25.15 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.96 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  28.28 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.92 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  28.99 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.9 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1980  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.49 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.31 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  24.46 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  24.46 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.17 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.01 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.52 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.45 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.55 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.44 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.47 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.8 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.55 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  24.16 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  24.24 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  24.24 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.75 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.55 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.36 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  24.1 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3497  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.44 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2055  microcin immunity protein MccF  37.93 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.2 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.76 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  21.96 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.19 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  25.08 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.68 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  22.83 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.09 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  25.57 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.73 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.26 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  20.8 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.4 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.4 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  23.64 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.44 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.34 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  21.18 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.32 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.81 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.05 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>