174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2340 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2340  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
306 aa  617  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.494558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28250  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  45.66 
 
 
374 aa  262  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1450  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  48.55 
 
 
344 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0157  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.93 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0245  microcin immunity protein  34.7 
 
 
344 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0633  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.51 
 
 
338 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.21 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.72 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.76 
 
 
305 aa  95.9  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.78 
 
 
363 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  24.23 
 
 
333 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  23.31 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.31 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  28.15 
 
 
312 aa  89.4  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.26 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  23.32 
 
 
333 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  23.32 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  23.32 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  23.47 
 
 
334 aa  86.3  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  23.64 
 
 
333 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.8 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.09 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  23 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  23.27 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1664  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.32 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.86 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.33 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.93 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.91 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.69 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.9 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.33 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  23.1 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.95 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0083  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.49 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.57 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  21.8 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.78 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.24 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.06 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.08 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4524  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.87 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.16 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  21.8 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.38 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  23.41 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.04 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6860  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.22 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  23.78 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  22.73 
 
 
300 aa  69.7  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  23.78 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.73 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  27.72 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.05 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.16 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  23.16 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1956  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.45 
 
 
319 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.16 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.53 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  23.43 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  25.39 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4176  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.2 
 
 
288 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  22.81 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  23.84 
 
 
324 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.63 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  22.43 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  22.19 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.28 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.2 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.9 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.52 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7443  putative muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.53 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.51 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.32 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  24.04 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.1 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.82 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  21.22 
 
 
328 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  19.8 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.89 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  19.14 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.65 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4434  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.09 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.66 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  26.74 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  21.18 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.97 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.15 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  18.81 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.74 
 
 
312 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  21.19 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  21.94 
 
 
317 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  25.26 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  25.38 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  20.08 
 
 
289 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  22.63 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  22.79 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  21.5 
 
 
361 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>