133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3191 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3191  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
338 aa  699    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  42.4 
 
 
343 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  42.4 
 
 
343 aa  279  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  42.4 
 
 
343 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  42.69 
 
 
343 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  42.69 
 
 
343 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  41.64 
 
 
343 aa  275  8e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  41.81 
 
 
343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  42.11 
 
 
343 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  42.11 
 
 
343 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3497  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.61 
 
 
360 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.28 
 
 
339 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  27.3 
 
 
364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  29.11 
 
 
322 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  26.65 
 
 
328 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  26.51 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  26.51 
 
 
328 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1980  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.29 
 
 
347 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195762  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.57 
 
 
333 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  27.67 
 
 
318 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  26.05 
 
 
328 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.2 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.75 
 
 
328 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  25.79 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  25.88 
 
 
346 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  25.43 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  27.01 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  25.21 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.4 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  25.75 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  25.21 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.04 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  25.21 
 
 
333 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.51 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  25.14 
 
 
333 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  25.14 
 
 
333 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.87 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.06 
 
 
331 aa  92.4  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  24.93 
 
 
333 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.55 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  24.71 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.74 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  24.35 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1719  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.3 
 
 
365 aa  88.6  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.36 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.42 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.37 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0633  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.35 
 
 
338 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.66 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.77 
 
 
339 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  26.45 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.41 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.76 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3337  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.65 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.61 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9163  hypothetical protein  22.95 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  25.48 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.07 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.52 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  24.63 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.91 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0157  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.62 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  24.12 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  24.05 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.41 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.42 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.14 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  24.41 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.85 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  22.22 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  24.12 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.12 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  24.12 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24040  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  22.16 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  24.34 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  26.75 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  24.41 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  26.3 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  31.91 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.26 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  23.64 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.14 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6755  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.07 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12577  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  24.55 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2777  LD-carboxypeptidase family protein  26.75 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.41 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0524355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1450  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.41 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.68 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.01 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.62 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.05 
 
 
297 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.56 
 
 
312 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.62 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.73 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  23.53 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  23.53 
 
 
312 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.66 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0245  microcin immunity protein  22.26 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24 
 
 
300 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13490  hypothetical protein  44.83 
 
 
58 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>