131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3337 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3337  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  100 
 
 
350 aa  696    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24040  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  66.09 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9163  hypothetical protein  56.2 
 
 
348 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1980  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  44.81 
 
 
347 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195762  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3497  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.35 
 
 
360 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1719  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.44 
 
 
365 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  28.32 
 
 
343 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  27.91 
 
 
343 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  27.67 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  27.67 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  28.32 
 
 
343 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.75 
 
 
343 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  27.95 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  27.38 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  26.38 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  27.86 
 
 
334 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  27.57 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.7 
 
 
331 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.47 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.52 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.45 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.23 
 
 
305 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.57 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  24.93 
 
 
328 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3191  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.65 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  24.36 
 
 
346 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  24.21 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  24.21 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  23.92 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  30.06 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  25.22 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  23.92 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  24.08 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  24.09 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  24.09 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  23.63 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  24.28 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.94 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.81 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.28 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.99 
 
 
333 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.55 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.21 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.09 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  39.38 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.34 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.52 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.09 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.79 
 
 
321 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  25.5 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.83 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.31 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.65 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  26.76 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  34.88 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.84 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  23.88 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  43.59 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.59 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  34.11 
 
 
293 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  23.08 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.04 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  22.86 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.29 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.56 
 
 
363 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  31.11 
 
 
324 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.33 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.08 
 
 
348 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.86 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.07 
 
 
320 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.91 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  28.17 
 
 
326 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.53 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  30.82 
 
 
297 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2055  microcin immunity protein MccF  30.43 
 
 
127 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  22.57 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  22.92 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  22.29 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  22.29 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  22.29 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  32.52 
 
 
301 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.28 
 
 
322 aa  59.7  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  22 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  22 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.03 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  26.03 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  40 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0362  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  41.03 
 
 
298 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2777  LD-carboxypeptidase family protein  29.17 
 
 
289 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  21.72 
 
 
299 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  33.09 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  22.29 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.23 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  29.17 
 
 
289 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.5 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3393  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  31.36 
 
 
344 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.370243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4962  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.9 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2200  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.43 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.498556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.82 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  21.14 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>