166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24040  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  100 
 
 
348 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3337  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  66.09 
 
 
350 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9163  hypothetical protein  53.31 
 
 
348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1980  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  39.48 
 
 
347 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195762  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3497  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.81 
 
 
360 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.581364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1719  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  36.49 
 
 
365 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3040  hypothetical protein  27.09 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.556512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3275  hypothetical protein  27.09 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2982  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.65 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3018  microcin C7 self-immunity protein  27.33 
 
 
343 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3281  MccC family protein  26.93 
 
 
343 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3289  microcin C7 self-immunity protein MccF  26.88 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3266  hypothetical protein  26.51 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1993  microcin C7 self-immunity protein MccF  26.67 
 
 
343 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2964  microcin C7 self-immunity protein  26.61 
 
 
343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  27.83 
 
 
334 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  28.15 
 
 
334 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  25.42 
 
 
328 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  25.21 
 
 
328 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  25.14 
 
 
328 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  24 
 
 
346 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  25.14 
 
 
328 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.86 
 
 
328 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  25.14 
 
 
328 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.42 
 
 
328 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.86 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.41 
 
 
339 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.71 
 
 
328 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.53 
 
 
310 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.84 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.45 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  30.24 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  26.3 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  30.03 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.24 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  24.07 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  29.71 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.13 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  24.28 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  24.28 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  24.14 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.5 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  26.64 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  26.3 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3337  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.88 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.66 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  23.56 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.78 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  23.7 
 
 
333 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.64 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  24 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  21.51 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0711  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.03 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374689  normal  0.0271624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.09 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  25.22 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  25.22 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  25.22 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  25.22 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  25.22 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0019  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.7 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.78 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  23.36 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.6 
 
 
341 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  20.93 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3191  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.16 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.43 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.43 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.22 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  21.84 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.47 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.45 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  30.24 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.86 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  24.35 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.8 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3460  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.99 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0181696 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2030  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  30.03 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.630907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.87 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  26.16 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3212  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  37.79 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  23.84 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.36 
 
 
316 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2016  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  27.17 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.731206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5403  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  34.1 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.381396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  30.77 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.09 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.11 
 
 
299 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1087  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.26 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.45 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  25.44 
 
 
317 aa  63.9  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.85 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  31.4 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5967  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.7 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2668  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.93 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.88 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1845  L,D-carboxypeptidase A  28.87 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0048  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.32 
 
 
321 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1996  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  27.08 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.506424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3454  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  32.3 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000129902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>