212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2777 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2777  LD-carboxypeptidase family protein  100 
 
 
289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2464  LD-carboxypeptidase family protein  95.5 
 
 
289 aa  553  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0687  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.63 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000215417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4176  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  28.67 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1985  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.4 
 
 
339 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5463  hypothetical protein  32.8 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0745  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.44 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5215  hypothetical protein  32.8 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5613  hypothetical protein  32.8 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5544  hypothetical protein  33.66 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5457  hypothetical protein  33.12 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5063  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.79 
 
 
328 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.47 
 
 
328 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5495  hypothetical protein  32.47 
 
 
346 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1976  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.67 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0175337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5487  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  32.47 
 
 
328 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0886  microcin immunity protein MccF  26.77 
 
 
334 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0584  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.12 
 
 
348 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0601  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.44 
 
 
348 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.62332  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1817  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.94 
 
 
333 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4926  twin-arginine translocation pathway signal  26.03 
 
 
361 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0123  hypothetical protein  27.53 
 
 
297 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2712  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.22 
 
 
310 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0829  microcin immunity protein MccF  26.45 
 
 
334 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.181622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3880  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  30.23 
 
 
328 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2258  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.58 
 
 
363 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000465368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0082  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.7 
 
 
299 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.176259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4910  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.91 
 
 
310 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128851  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1809  microcin immunity protein MccF  28.39 
 
 
333 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1949  microcin immunity protein MccF  28.39 
 
 
333 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2768  LD-carboxypeptidase family protein  27.46 
 
 
293 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2033  microcin immunity protein MccF  28.3 
 
 
333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.149392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1766  microcin immunity protein  27.74 
 
 
333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1955  microcin C7 self-immunity protein MccF  28.3 
 
 
333 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4459  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  29.01 
 
 
301 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0469  microcin C7 immunity protein  27.54 
 
 
321 aa  102  7e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1984  microcin immunity protein MccF  28.39 
 
 
333 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03642e-31 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2453  mccF-like protein  27.46 
 
 
293 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1783  microcin immunity protein  27.74 
 
 
333 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0982524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3374  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.19 
 
 
341 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.511147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5103  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.91 
 
 
301 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1838  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.48 
 
 
311 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.396505 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0048  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.12 
 
 
314 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.616431  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0027  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  26.53 
 
 
320 aa  99.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4304  MccF-like protein  25.24 
 
 
364 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.109642  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1218  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.99 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.190854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3373  microcin C7 self-immunity protein MccF  27.97 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00948575  hitchhiker  3.06185e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3582  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.56 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0622  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.03 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0209  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.52 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0633  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  28.76 
 
 
338 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4852  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.35 
 
 
312 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0046  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.49 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04130  putative carboxypeptidase  26.9 
 
 
300 aa  95.5  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0590  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  24.73 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00406541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1289  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.83 
 
 
306 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1871  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.51 
 
 
313 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05410  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.44 
 
 
331 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4799  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase, putative  27.94 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.26616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4674  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.94 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1254  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.13 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1256  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase; microcin immunity protein  24.13 
 
 
306 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1452  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.21 
 
 
338 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1418  hypothetical protein  24.48 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1456  hypothetical protein  24.13 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.946186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0925  microcin C7 resistance MccF related protein  24.73 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3925  hypothetical protein  24.13 
 
 
306 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1282  hypothetical protein  24.13 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1384  hypothetical protein  24.13 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.202295  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3395  peptidase S66, LD-carboxypeptidase A  22.97 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19840  uncharacterized MccF-like protein (microcin C7 resistance)  23.1 
 
 
306 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.261069  decreased coverage  0.0000458463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1482  hypothetical protein  23.43 
 
 
306 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1889  microcin immunity protein MccF, putative  24.76 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.953828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0854  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  24.57 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1874  microcin C7 resistance-like protein (MccF)  25.89 
 
 
324 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.235948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5153  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.61 
 
 
304 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1525  hypothetical protein  23.43 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0548  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.09 
 
 
297 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.883395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0029  Muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  25.17 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259405  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1963  hypothetical protein  21.68 
 
 
298 aa  85.5  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4290  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  27.88 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3904  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.83 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2396  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  26.61 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309773  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6400  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.92 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.80456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0047  muramoyltetrapeptide carboxypeptidase  23.53 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2621  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  24.31 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.799378  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1303  L,D-carboxypeptidase A  26.12 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0537897 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7092  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  23.13 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5012  peptidase U61, LD-carboxypeptidase A  25.6 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.915313  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1304  L,D-carboxypeptidase A  25.83 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.504378  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3989  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  27.39 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6110  L,D-carboxypeptidase A  25.75 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1967  L,D-carboxypeptidase A  25.75 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7067  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  25.52 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0799  hypothetical protein  25.42 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3542  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.59 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4498  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  23.93 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.68136  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1991  L,D-carboxypeptidase A  25.75 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3478  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  22.86 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2333  L,D-carboxypeptidase A  25 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.602476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>