218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0835 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  40.27 
 
 		 889 aa  637    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  41.31 
 
 		 879 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 		 882 aa  1797    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  38.1 
 
 		 877 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  37.98 
 
 		 877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  37.87 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  37.22 
 
 		 877 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  37.22 
 
 		 877 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  37.32 
 
 		 877 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  37.11 
 
 		 918 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  38.18 
 
 		 878 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  37 
 
 		 877 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  36.89 
 
 		 877 aa  588  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  35.85 
 
 		 887 aa  557  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  35.98 
 
 		 875 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.38 
 
 		 871 aa  485  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  29.91 
 
 		 906 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  27.09 
 
 		 850 aa  278  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  29.19 
 
 		 855 aa  270  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  29.05 
 
 		 846 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  26.68 
 
 		 853 aa  264  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  28.12 
 
 		 849 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  28.39 
 
 		 848 aa  259  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  29.08 
 
 		 855 aa  259  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  27.23 
 
 		 853 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  29.62 
 
 		 865 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  27.59 
 
 		 853 aa  253  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  26.42 
 
 		 850 aa  250  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  28.86 
 
 		 867 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  28.74 
 
 		 867 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  28.74 
 
 		 867 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  26.84 
 
 		 863 aa  246  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  27.38 
 
 		 852 aa  246  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  28.02 
 
 		 868 aa  244  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  28.16 
 
 		 854 aa  243  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  25.95 
 
 		 853 aa  241  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  28.38 
 
 		 869 aa  241  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  28.22 
 
 		 862 aa  239  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  28.59 
 
 		 868 aa  238  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  25.85 
 
 		 856 aa  238  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  25.52 
 
 		 861 aa  237  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.63 
 
 		 853 aa  234  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  25.42 
 
 		 851 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  28.3 
 
 		 889 aa  231  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  24.84 
 
 		 858 aa  231  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  26.64 
 
 		 862 aa  230  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  25.5 
 
 		 848 aa  229  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  27.91 
 
 		 861 aa  228  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  25.81 
 
 		 848 aa  226  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  26.59 
 
 		 892 aa  223  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  28.96 
 
 		 838 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  25.98 
 
 		 853 aa  221  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  27.48 
 
 		 837 aa  221  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  25.9 
 
 		 860 aa  220  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  26.87 
 
 		 874 aa  220  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  26.28 
 
 		 858 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  26.21 
 
 		 849 aa  219  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  26.05 
 
 		 842 aa  217  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  25.6 
 
 		 862 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  25.83 
 
 		 848 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  26.68 
 
 		 871 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  25.81 
 
 		 876 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  25.49 
 
 		 851 aa  213  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  24.43 
 
 		 869 aa  208  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  25.45 
 
 		 887 aa  196  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  26.18 
 
 		 882 aa  197  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  24.87 
 
 		 882 aa  180  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  27.48 
 
 		 834 aa  178  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.3 
 
 		 858 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  27.85 
 
 		 857 aa  176  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  24.31 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  28.29 
 
 		 823 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.36 
 
 		 854 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  29.09 
 
 		 878 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.34 
 
 		 869 aa  151  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.81 
 
 		 835 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.37 
 
 		 859 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.89 
 
 		 859 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.79 
 
 		 857 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.69 
 
 		 877 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.84 
 
 		 913 aa  97.8  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.61 
 
 		 778 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.63 
 
 		 859 aa  95.9  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.66 
 
 		 785 aa  95.1  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.88 
 
 		 830 aa  94  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0300  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  23.66 
 
 		 768 aa  92  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.54 
 
 		 784 aa  90.1  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.78 
 
 		 853 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.58 
 
 		 846 aa  89.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  21.4 
 
 		 875 aa  85.1  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0335  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  22.38 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  22.22 
 
 		 905 aa  83.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0347  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.72 
 
 		 878 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.707127  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  21.63 
 
 		 883 aa  81.3  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.55 
 
 		 835 aa  81.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1225  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.11 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.921665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  22.22 
 
 		 829 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.92 
 
 		 863 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  22.41 
 
 		 890 aa  77.4  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3425  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.04 
 
 		 834 aa  77  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.279831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>