More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1381 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  54.24 
 
 
850 aa  860    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  52.49 
 
 
851 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  47.72 
 
 
853 aa  719    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  51.53 
 
 
855 aa  823    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  50.51 
 
 
862 aa  776    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  48.69 
 
 
861 aa  746    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  49.25 
 
 
849 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  53.29 
 
 
865 aa  815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  51.49 
 
 
868 aa  791    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  49.66 
 
 
867 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  51.95 
 
 
846 aa  813    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  52.85 
 
 
855 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  48.62 
 
 
858 aa  753    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  52.55 
 
 
853 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  44.07 
 
 
874 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  51.38 
 
 
858 aa  837    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  51.38 
 
 
854 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  52.3 
 
 
862 aa  788    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  52.6 
 
 
862 aa  829    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  44.62 
 
 
869 aa  693    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  43.84 
 
 
871 aa  694    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  51.15 
 
 
860 aa  814    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  50.64 
 
 
852 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  49.71 
 
 
889 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  49.54 
 
 
867 aa  759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  49.01 
 
 
848 aa  756    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  53.91 
 
 
848 aa  864    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  51.46 
 
 
848 aa  829    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  44.27 
 
 
876 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  50.47 
 
 
853 aa  792    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  51.69 
 
 
861 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  54.25 
 
 
850 aa  883    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  100 
 
 
863 aa  1760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  51.53 
 
 
853 aa  818    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  49.54 
 
 
867 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  49.71 
 
 
869 aa  759    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  48.1 
 
 
868 aa  704    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  49.14 
 
 
856 aa  774    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  48.84 
 
 
887 aa  735    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  50.35 
 
 
849 aa  805    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  48.27 
 
 
851 aa  762    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  43.23 
 
 
892 aa  635  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  43.12 
 
 
837 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  42.21 
 
 
838 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  41.05 
 
 
882 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  39.31 
 
 
882 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  41.38 
 
 
878 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  42.76 
 
 
857 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  38.4 
 
 
842 aa  514  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  37.67 
 
 
834 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  36.58 
 
 
877 aa  465  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  35.83 
 
 
877 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  35.83 
 
 
877 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  35.83 
 
 
918 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  36.4 
 
 
877 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  36.15 
 
 
877 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  36.32 
 
 
877 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  36.27 
 
 
877 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  35.38 
 
 
877 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  35.08 
 
 
889 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  35.18 
 
 
879 aa  445  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  31.73 
 
 
853 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  31.94 
 
 
848 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.91 
 
 
878 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  35.99 
 
 
875 aa  435  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  31.48 
 
 
853 aa  432  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  32.49 
 
 
906 aa  429  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  34.18 
 
 
887 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  34.95 
 
 
823 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  35.97 
 
 
807 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.84 
 
 
882 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.03 
 
 
859 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.21 
 
 
852 aa  203  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.67 
 
 
859 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.67 
 
 
785 aa  201  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.26 
 
 
857 aa  201  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.69 
 
 
859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  35.03 
 
 
881 aa  198  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.39 
 
 
784 aa  197  7e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.98 
 
 
778 aa  194  6e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.5 
 
 
871 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.42 
 
 
882 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.06 
 
 
858 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  31.94 
 
 
890 aa  192  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  34.76 
 
 
895 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  30.18 
 
 
883 aa  191  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.86 
 
 
853 aa  191  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.16 
 
 
869 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.83 
 
 
854 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.93 
 
 
835 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.08 
 
 
913 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
830 aa  182  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.2 
 
 
886 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  27.83 
 
 
870 aa  179  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.47 
 
 
933 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.39 
 
 
932 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.74 
 
 
863 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.24 
 
 
932 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  33.52 
 
 
844 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.72 
 
 
877 aa  167  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>