91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0962 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
871 aa  1784    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  45.66 
 
 
879 aa  736    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  39.17 
 
 
877 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  38.75 
 
 
877 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  38.86 
 
 
877 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  38.31 
 
 
877 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  38.31 
 
 
877 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  37.46 
 
 
877 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  37.68 
 
 
877 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  37.57 
 
 
877 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  37.57 
 
 
918 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  37.83 
 
 
889 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  37.46 
 
 
878 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  36.01 
 
 
887 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  35.93 
 
 
875 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  35.45 
 
 
882 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  30.1 
 
 
906 aa  365  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  26.9 
 
 
853 aa  213  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000100664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  25 
 
 
850 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  24.39 
 
 
848 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  25 
 
 
849 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  24.55 
 
 
855 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  23.51 
 
 
848 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  24.37 
 
 
852 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  25.15 
 
 
856 aa  197  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  24.78 
 
 
855 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  24.7 
 
 
854 aa  196  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  25.5 
 
 
850 aa  195  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  23.5 
 
 
863 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  24.12 
 
 
861 aa  192  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  25.58 
 
 
869 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  25.41 
 
 
889 aa  191  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  24.06 
 
 
853 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  26.31 
 
 
874 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  25.45 
 
 
876 aa  184  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  24.66 
 
 
853 aa  184  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  24.42 
 
 
868 aa  184  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  24.84 
 
 
853 aa  184  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  24.4 
 
 
853 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  23.8 
 
 
867 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  23.68 
 
 
867 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  24.22 
 
 
862 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  23.68 
 
 
867 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  23.44 
 
 
862 aa  181  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  25.26 
 
 
861 aa  179  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  24.41 
 
 
868 aa  178  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  26.21 
 
 
865 aa  175  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  23.45 
 
 
871 aa  174  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  24.7 
 
 
848 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  24.05 
 
 
849 aa  173  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  23.84 
 
 
837 aa  172  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  24.35 
 
 
858 aa  172  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  0.0000185174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  25.78 
 
 
887 aa  170  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  23.03 
 
 
846 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  24.33 
 
 
858 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  24.51 
 
 
860 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  22.94 
 
 
851 aa  157  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  23.01 
 
 
869 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  23.84 
 
 
862 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  22.34 
 
 
851 aa  151  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  23.98 
 
 
853 aa  150  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  22.5 
 
 
842 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  25.57 
 
 
882 aa  148  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  22.87 
 
 
892 aa  140  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  21.5 
 
 
848 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  21.82 
 
 
882 aa  135  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  22.95 
 
 
834 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  21.03 
 
 
807 aa  124  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  22.48 
 
 
838 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  21.64 
 
 
857 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  19.98 
 
 
878 aa  90.9  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  21.33 
 
 
823 aa  89  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.78 
 
 
858 aa  76.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.24 
 
 
854 aa  70.5  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.42 
 
 
869 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.08 
 
 
830 aa  65.5  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.65 
 
 
835 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.1 
 
 
929 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.93 
 
 
932 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.22 
 
 
933 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  19.91 
 
 
823 aa  48.9  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  19.77 
 
 
932 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  22.91 
 
 
881 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.83 
 
 
882 aa  47  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  20.61 
 
 
778 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  20.46 
 
 
870 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.26 
 
 
852 aa  45.8  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  21.52 
 
 
859 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.62 
 
 
822 aa  44.3  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1136  HEAT repeat-containing PBS lyase  20 
 
 
865 aa  44.3  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.332522  normal  0.469366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  21.09 
 
 
863 aa  44.3  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>