42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3349 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3349  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
280 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1823  hypothetical protein  23.86 
 
 
298 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.21 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.62 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0431  alpha/beta hydrolase fold-1 protein  29.13 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.664922  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
275 aa  47  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  26.11 
 
 
265 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
270 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  21.18 
 
 
255 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
264 aa  45.8  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  22.12 
 
 
474 aa  45.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.51 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2443  hydrolase  29.41 
 
 
271 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.788675  normal  0.130051 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  21.81 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  25.68 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  22.6 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  23.36 
 
 
263 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  21.07 
 
 
504 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.11 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1451  Alpha/beta hydrolase  20.08 
 
 
265 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  20.74 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  22.01 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  20.68 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  20.66 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4235  putative hydrolase, alpha/beta fold family  21.33 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
405 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  21.45 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  21.14 
 
 
270 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>