52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0145 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0145  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  746    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0522  glycosyl transferase group 1  50.14 
 
 		 378 aa  378  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5040  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2463  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.52 
 
 		 249 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1156  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.656531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2914  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  38.95 
 
 		 564 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.41 
 
 		 400 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 405 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 411 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  38.6 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  24.08 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  28.72 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  25.47 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0741  glycosyltransferase-like protein  48.84 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.54 
 
 		 411 aa  43.9  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 378 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  24.37 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2166  glycosyl transferase group 1  52.27 
 
 		 828 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  24.8 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.37 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2444  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.12 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 414 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  28.78 
 
 		 363 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 499 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  24.46 
 
 		 406 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 		 1177 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>