59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4144 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4144  putative permease  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.4015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4194  putative permease  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4088  putative permease  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4253  hypothetical protein  99.14 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4073  hypothetical protein  98.71 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1404  hypothetical protein  53.95 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0111  hypothetical protein  44.26 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.485373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6583  hypothetical protein  41.2 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.286525 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  33.33 
 
 		 270 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  35.2 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0896  protein of unknown function UPF0005  34.82 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  41.24 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  34.56 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  36.28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  36.28 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  37.11 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2473  hypothetical protein  46.67 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000529364  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  25.89 
 
 		 252 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  36.75 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  27.59 
 
 		 283 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  35.04 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  35.04 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  35.04 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  35.9 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  35.9 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  35.04 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1011  hypothetical protein  36.51 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  28.77 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0978  hypothetical protein  36.51 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  34.55 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  32.5 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  33.93 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  36.84 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  41.79 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  39.13 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1221  protein of unknown function UPF0005  38.54 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  34.74 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  37.35 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1767  hypothetical protein  40.45 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000691139  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  28.19 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  34.44 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  35.4 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  34.44 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  34.44 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2686  protein of unknown function UPF0005  37.89 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  31.37 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  29.87 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  38.81 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  38.81 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  34.44 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  38.81 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  38.81 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  34.44 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2376  hypothetical protein  35.14 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.128059  normal  0.023918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  33.04 
 
 		 261 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  40.58 
 
 		 219 aa  42  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2846  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0018864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  40.58 
 
 		 220 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2537  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>