96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1840 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1840  transposase IS66  100 
 
 		 143 aa  277  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4165  transposase IS66  90.44 
 
 		 523 aa  189  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.699531  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4308  hypothetical protein  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4305  hypothetical protein  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3763  hypothetical protein  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.727828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3722  hypothetical protein  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3715  IS66 Orf2 family protein  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0171  transposase IS66  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0431  transposase IS66  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0146215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1419  transposase IS66  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0915  transposase IS66  88.24 
 
 		 523 aa  178  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1809  transposase IS66  88.24 
 
 		 323 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3516  IS66 Orf2 family protein  87.3 
 
 		 513 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.578775  normal  0.957908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  47.9 
 
 		 461 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  46.22 
 
 		 341 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  47.15 
 
 		 527 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  42.98 
 
 		 514 aa  87.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  42.02 
 
 		 539 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  41.41 
 
 		 529 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  38.21 
 
 		 537 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  38.58 
 
 		 553 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  38.58 
 
 		 553 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1223  IS66 family transposase  44.44 
 
 		 520 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0185  IS66 family transposase  44.44 
 
 		 520 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2402  IS66 Orf2 family protein  87.18 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4598  transposase IS66  36.23 
 
 		 510 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.864978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6322  transposase IS66  38.54 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4341  transposase IS66  38.54 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8372  transposase IS66  38.54 
 
 		 505 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2744  transposase IS66  35 
 
 		 524 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4328  transposase IS66  37.25 
 
 		 524 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4686  transposase IS66  37.25 
 
 		 524 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1190  transposase IS66  41.11 
 
 		 435 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.808109  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1022  transposase IS66  41.11 
 
 		 519 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1401  transposase IS66  41.11 
 
 		 519 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2523  transposase IS66  41.11 
 
 		 517 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297904  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  30.51 
 
 		 545 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  30.51 
 
 		 545 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  30.51 
 
 		 545 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  30.51 
 
 		 545 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  30.51 
 
 		 545 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1222  transposase IS66  35.92 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21696  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6364  transposase IS66  35.92 
 
 		 524 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  30.51 
 
 		 545 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6097  transposase IS66  35.92 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5514  transposase IS66  35.92 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.90828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0650  hypothetical protein  40.43 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1086  transposase family  37.37 
 
 		 521 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  35.38 
 
 		 530 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0609  hypothetical protein  48.1 
 
 		 234 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  34.62 
 
 		 530 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4976  transposase IS66  37.23 
 
 		 531 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000420547  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  34.62 
 
 		 694 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3794  putative transposase  30.71 
 
 		 540 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1865  transposase IS66  30.71 
 
 		 540 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223463  normal  0.192922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2416  IS66 family transposase  30.71 
 
 		 540 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.521306  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4641  transposase IS66  32 
 
 		 477 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4705  transposase IS66  32 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465239  normal  0.0997646 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4709  transposase IS66  32 
 
 		 497 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276755  normal  0.140797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2711  transposase IS66  30 
 
 		 506 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5560  transposase IS66  32.54 
 
 		 516 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2726  transposase IS66  32.81 
 
 		 516 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0344579  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  35 
 
 		 512 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4782  transposase IS66  31.97 
 
 		 530 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2591  putative transposase, TnpC  37.01 
 
 		 524 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0422  transposase IS66  32.28 
 
 		 274 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  35 
 
 		 512 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5982  transposase IS66  35.51 
 
 		 523 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6199  transposase IS66  32.52 
 
 		 549 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.07824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4181  hypothetical protein  41.82 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3778  hypothetical protein  34.95 
 
 		 532 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1449  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.324951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1447  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0541647  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2735  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0134007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2688  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1450  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1439  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3140  TnpC protein  32.52 
 
 		 523 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6857  transposase IS66  33.6 
 
 		 520 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>