12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4181 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0659  transposase IS66  78.79 
 
 		 514 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9623  transposase  80.41 
 
 		 539 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264971  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8231  transposase  78.72 
 
 		 553 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8249  transposase  78.72 
 
 		 553 aa  139  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0693  transposase  53.23 
 
 		 537 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4877  transposase IS66  53.45 
 
 		 529 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386958  normal  0.659358 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  49.18 
 
 		 527 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0609  hypothetical protein  46.88 
 
 		 234 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3983  transposase IS66  39.73 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3307  transposase IS66  47.14 
 
 		 341 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.448509 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  37.18 
 
 		 521 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0611457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>