More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1224 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  100 
 
 		 219 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0561  putative translaldolase  92.63 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2213  putative translaldolase  92.63 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  80.18 
 
 		 217 aa  358  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2499  putative translaldolase  80.65 
 
 		 217 aa  351  4e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  75.12 
 
 		 217 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  77.42 
 
 		 217 aa  337  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  75.69 
 
 		 218 aa  328  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  70.83 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  70.83 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  72.22 
 
 		 217 aa  318  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  69.44 
 
 		 217 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  68.2 
 
 		 217 aa  312  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  68.52 
 
 		 217 aa  310  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2390  putative translaldolase  68.66 
 
 		 217 aa  301  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1807  putative translaldolase  67.59 
 
 		 216 aa  297  8e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0219  putative translaldolase  66.82 
 
 		 217 aa  285  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  63.89 
 
 		 217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  62.67 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  58.88 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  59.72 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  59.24 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  59.24 
 
 		 217 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  58.37 
 
 		 215 aa  257  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  58.77 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  57.42 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  54.63 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  56.46 
 
 		 215 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  56.46 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  60.19 
 
 		 221 aa  248  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  57.35 
 
 		 215 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  56.87 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  56.22 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  56.46 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0461  putative translaldolase  52.73 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.541779  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4567  putative translaldolase  55.81 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0244923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  56.4 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0575  putative translaldolase  52.73 
 
 		 220 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.267476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2002  putative translaldolase  52.56 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  54.21 
 
 		 215 aa  241  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  56.4 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  55.92 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  54.21 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  56.54 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  55.02 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  54.67 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  56.46 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  54.21 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  54.42 
 
 		 221 aa  238  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  54.03 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  53.77 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  56.28 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  54.5 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1679  putative translaldolase  57.21 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  53.08 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  51.4 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_002978  WD0551  putative translaldolase  55.4 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.195885  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10763  transaldolase  55.35 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  54.88 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  52.56 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  55.02 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0859  transaldolase  52.38 
 
 		 218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260947  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  52.13 
 
 		 213 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0348  transaldolase  53.7 
 
 		 219 aa  231  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  53.08 
 
 		 213 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  53.08 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  50.71 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  50.71 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  54.29 
 
 		 223 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  51.89 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  52.8 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  50.46 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  51.6 
 
 		 226 aa  228  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  51.87 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  52.09 
 
 		 218 aa  227  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  50.24 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  52.63 
 
 		 215 aa  226  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  50.71 
 
 		 213 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  50.24 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  52.13 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  52.29 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  47.39 
 
 		 214 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  53.67 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1617  putative translaldolase  50.72 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.68497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  54.03 
 
 		 215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  55.19 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  48.37 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1777  transaldolase  51.43 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23680  transaldolase  50 
 
 		 226 aa  217  8.999999999999998e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00402875  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  51.18 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  50.46 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  51.39 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1479  transaldolase  53.08 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>