More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23680  transaldolase  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00402875  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1087  transaldolase  79.2 
 
 
220 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000179872  hitchhiker  0.0000000000000152073 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09310  transaldolase  78.32 
 
 
226 aa  356  9.999999999999999e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.6067 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0332  transaldolase  64 
 
 
226 aa  299  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0473  transaldolase  55.31 
 
 
223 aa  254  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0799  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000767356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0738  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0727  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53489e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0637  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0581  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0580  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0670  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0907799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0702  putative translaldolase  52.23 
 
 
215 aa  244  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03280  putative transaldolase  51.77 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0309181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0565  putative translaldolase  52.68 
 
 
215 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000239698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0584  putative translaldolase  50.89 
 
 
215 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2230  putative translaldolase  51.08 
 
 
223 aa  241  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0911781  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0497  putative translaldolase  52.47 
 
 
214 aa  240  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4636  putative translaldolase  50.89 
 
 
215 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0957059  unclonable  2.60878e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0051  putative transaldolase  51.33 
 
 
221 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2486  putative transaldolase  51.11 
 
 
214 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4411  putative transaldolase  50.44 
 
 
221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0636  putative translaldolase  51.8 
 
 
218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1110  putative translaldolase  52.7 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0705  putative translaldolase  50.67 
 
 
214 aa  237  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.931259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1619  putative translaldolase  52.68 
 
 
216 aa  237  9e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0617  putative translaldolase  50.9 
 
 
218 aa  235  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000452349  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0278  putative translaldolase  51.34 
 
 
216 aa  234  6e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.415561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2977  putative translaldolase  51.57 
 
 
214 aa  234  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.324896  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0815  putative translaldolase  52 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0010  transaldolase  51.11 
 
 
214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.896491  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1229  putative translaldolase  50.22 
 
 
217 aa  232  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0485  transaldolase  50.22 
 
 
214 aa  232  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2875  putative translaldolase  51.09 
 
 
222 aa  231  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1361  transaldolase  51.8 
 
 
216 aa  231  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0166838  normal  0.338675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2479  putative translaldolase  50.43 
 
 
222 aa  230  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.426562  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0285  putative translaldolase  50.22 
 
 
215 aa  230  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2877  transaldolase  50.89 
 
 
215 aa  230  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000016267  hitchhiker  0.00000329415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2698  putative translaldolase  50 
 
 
226 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4211  putative translaldolase  49.12 
 
 
217 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1070  putative translaldolase  49.56 
 
 
215 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.144646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4063  putative translaldolase  49.12 
 
 
217 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.379343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0624  putative translaldolase  49.78 
 
 
214 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.04318e-35 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1927  putative translaldolase  51.35 
 
 
217 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0834254  hitchhiker  0.00000000106475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1459  putative transaldolase  51.8 
 
 
218 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0553  putative translaldolase  50.23 
 
 
215 aa  228  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2476  putative translaldolase  49.35 
 
 
223 aa  228  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0373  putative translaldolase  49.33 
 
 
214 aa  227  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4615  putative transaldolase  52.49 
 
 
217 aa  227  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4186  putative translaldolase  48.67 
 
 
217 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0610  putative translaldolase  48.88 
 
 
214 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3212  putative translaldolase  50.45 
 
 
217 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0294  putative translaldolase  49.78 
 
 
214 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2037  transaldolase  53.1 
 
 
219 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000238451  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0417  putative transaldolase  50.68 
 
 
217 aa  224  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.67449  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1366  putative translaldolase  49.77 
 
 
215 aa  224  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.705012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0636  transaldolase  52.25 
 
 
217 aa  223  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3442  putative translaldolase  49.55 
 
 
213 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1738  putative translaldolase  48.2 
 
 
217 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0230  putative translaldolase  49.33 
 
 
220 aa  223  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1805  putative translaldolase  48.2 
 
 
217 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.110565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1099  putative translaldolase  47.75 
 
 
217 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0618  putative translaldolase  48.42 
 
 
215 aa  222  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.911017  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21800  putative transaldolase  49.1 
 
 
213 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0364  putative translaldolase  50.91 
 
 
217 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0154992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1350  transaldolase  47.79 
 
 
217 aa  221  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0395427  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3332  putative translaldolase  49.11 
 
 
213 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4838  transaldolase  47.77 
 
 
213 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000777517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0684  putative translaldolase  48.89 
 
 
215 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1147  putative transaldolase  47.3 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143358  normal  0.104107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1032  putative translaldolase  49.55 
 
 
217 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0683  putative translaldolase  48.89 
 
 
215 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3175  putative transaldolase  47.98 
 
 
216 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000196987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3027  transaldolase  49.11 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32955  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0074  putative translaldolase  48.66 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2529  putative translaldolase  48.44 
 
 
218 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2403  putative translaldolase  53.33 
 
 
215 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1161  putative translaldolase  46.22 
 
 
221 aa  218  7e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1224  putative translaldolase  50 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1102  putative translaldolase  47.79 
 
 
246 aa  218  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.150753  hitchhiker  0.00417913 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1253  transaldolase  49.12 
 
 
218 aa  217  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0294047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2379  putative translaldolase  48.86 
 
 
217 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2088  putative translaldolase  50.43 
 
 
222 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1489  putative translaldolase  50.67 
 
 
217 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1809  putative translaldolase  50.67 
 
 
215 aa  214  8e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0461  putative translaldolase  46.15 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.541779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0058  transaldolase  49.78 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0401075  hitchhiker  0.00104949 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0106  putative translaldolase  45.5 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5045  putative translaldolase  46.88 
 
 
218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4909  putative translaldolase  48.18 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0364  putative translaldolase  44.84 
 
 
215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0396985  normal  0.678872 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2783  transaldolase  49.78 
 
 
215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2410  transaldolase  46.4 
 
 
213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00815052  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2928  putative translaldolase  45.5 
 
 
217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0575  putative translaldolase  46.15 
 
 
220 aa  211  7.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.267476  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1864  transaldolase  45.29 
 
 
226 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0301  putative transaldolase  47.77 
 
 
222 aa  209  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.103898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0499  putative translaldolase  46.22 
 
 
217 aa  208  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000254528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2130  putative translaldolase  47.53 
 
 
219 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0013  transaldolase  48 
 
 
217 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>