163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2716 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2716  acyltransferase 3  100 
 
 
367 aa  724    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2715  acyltransferase 3  90.19 
 
 
367 aa  588  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.714877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0690  acyltransferase 3  50.13 
 
 
390 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0303876  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  30.18 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  33.33 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  25.33 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  25.8 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  26.01 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.46 
 
 
660 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.51 
 
 
616 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.09 
 
 
637 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  27.58 
 
 
667 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.19 
 
 
657 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  26.84 
 
 
354 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.86 
 
 
598 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  26.88 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  25.6 
 
 
657 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.69 
 
 
638 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  25.79 
 
 
377 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  25.65 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  26.03 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2128  acyltransferase family protein  26.03 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  26.03 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  26.03 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  23.12 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  23.98 
 
 
604 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  23.98 
 
 
604 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.75 
 
 
665 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  25.77 
 
 
375 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  25.77 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  25.77 
 
 
375 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  29.63 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.24 
 
 
662 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  25 
 
 
662 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  26.12 
 
 
377 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.22 
 
 
392 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  27.35 
 
 
683 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.07 
 
 
656 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.85 
 
 
660 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  33.33 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.75 
 
 
583 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  26.55 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  31.03 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  29.77 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  23.99 
 
 
690 aa  53.9  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.45 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  26.11 
 
 
641 aa  53.1  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  24.73 
 
 
634 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  25.93 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  25.55 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  24.93 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  25.96 
 
 
629 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  27.25 
 
 
367 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.27 
 
 
639 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.56 
 
 
710 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  29.14 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  24.56 
 
 
710 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.85 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  26.04 
 
 
643 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  31.93 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  29.94 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  23.81 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  24.48 
 
 
658 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  27.3 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  26.2 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  29.05 
 
 
635 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  24.3 
 
 
658 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.8 
 
 
690 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.11 
 
 
671 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  27.61 
 
 
759 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.44 
 
 
656 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3854  putative acyltransferase  26.77 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  29.06 
 
 
645 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  27.01 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  23.96 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.93 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  28.7 
 
 
437 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.94 
 
 
584 aa  49.3  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.05 
 
 
632 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  28.17 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  24.25 
 
 
658 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  26.77 
 
 
679 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  27.04 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  22.28 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  34.19 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  28.24 
 
 
644 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  25.6 
 
 
642 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.47 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  25.33 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  26.67 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  25.72 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  27.24 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.22 
 
 
675 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  27.61 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  24.02 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.98 
 
 
695 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  27.25 
 
 
684 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0731  acyltransferase family protein  26.35 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00610263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  27.1 
 
 
364 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  25.2 
 
 
660 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>