31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1986 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  37.78 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  40.76 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  37.44 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  30.88 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  32.59 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  31.55 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  33.63 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  30.14 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  35.67 
 
 		 168 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  30.8 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  26.32 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  30.49 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  32.21 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  37.5 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  23.79 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  27.35 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  30 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  31.49 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  24.26 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1294  hypothetical protein  28.32 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  32.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  23.91 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  20.8 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  29.21 
 
 		 175 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  21.72 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  22.63 
 
 		 319 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  22.95 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  24.39 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  32.18 
 
 		 146 aa  45.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>