20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NmulC_2780 on replicon NC_007616
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  48.22 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  48.55 
 
 
305 aa  292  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  25.7 
 
 
319 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  23.6 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  26.58 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  23.08 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  26.06 
 
 
225 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  21.78 
 
 
224 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  23.86 
 
 
246 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  25.64 
 
 
216 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  26.95 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  25.34 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  26.63 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  25.91 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  24.39 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  24.08 
 
 
277 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  26.77 
 
 
242 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  22.69 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  22.75 
 
 
220 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>