18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5597 on replicon NC_009340
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  30.2 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  27.35 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  26.67 
 
 
220 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  25.76 
 
 
305 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  25.4 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  26.82 
 
 
282 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  21.86 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  26.56 
 
 
225 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  24.27 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  25.21 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  21.91 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  25.33 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  25.34 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  26.78 
 
 
168 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  24.64 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  35.48 
 
 
164 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  23.85 
 
 
221 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>