22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0260 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  635    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  52.01 
 
 
308 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  48.55 
 
 
306 aa  292  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  27.41 
 
 
319 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  29.03 
 
 
282 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  25.25 
 
 
224 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  25.66 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  27.09 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  26 
 
 
225 aa  58.9  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  25.76 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  23.08 
 
 
221 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  25.63 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  25.39 
 
 
225 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  22.55 
 
 
246 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  21.72 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  23.64 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  23.22 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  23.14 
 
 
220 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  25.62 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  22.08 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  25 
 
 
153 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  26.09 
 
 
225 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>