28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0183 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  100 
 
 		 153 aa  316  7e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  77.63 
 
 		 225 aa  259  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  34.64 
 
 		 220 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  36.67 
 
 		 225 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  32.19 
 
 		 194 aa  83.6  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  33.57 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  32.21 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  37.23 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  34.69 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  34.97 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  29.23 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  31.72 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  32.39 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  38.05 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  26.59 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  25.59 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  27.33 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  31.69 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  33.66 
 
 		 175 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  30.47 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  26.95 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  27.37 
 
 		 271 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  24.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  23.76 
 
 		 308 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  26.92 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  27.56 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>