26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3948 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  713    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  25.77 
 
 		 282 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  31.19 
 
 		 225 aa  89.7  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  27.74 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  29.23 
 
 		 153 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  26.51 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  27.83 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  26.58 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  26.82 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  23.99 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  26.13 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  25.66 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  27.06 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  20.8 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  35.96 
 
 		 168 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  22.83 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  27.14 
 
 		 319 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  24.43 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  26.67 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  25 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  23 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  20.09 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  29.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  28.26 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  22.34 
 
 		 216 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>