25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5960 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  339  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  43.45 
 
 		 233 aa  117  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  42.95 
 
 		 186 aa  103  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  35.67 
 
 		 239 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  38.73 
 
 		 220 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  32.32 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  36.07 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  33.58 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  40.17 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  36.08 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  40.79 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  31.62 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  38.05 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  37 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  36.19 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  29.63 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  30.84 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  30.28 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  35.96 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  43.33 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  37.97 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  26.78 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  29.87 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  30.11 
 
 		 282 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>