24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0597 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  53.95 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  42.42 
 
 		 221 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  41.38 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  28.5 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  41.13 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  31.8 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  30.14 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  35.17 
 
 		 146 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  32.47 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  31.75 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  30.53 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  31.62 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  32.22 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  34.97 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  33.58 
 
 		 168 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  27.43 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  26.06 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  25.25 
 
 		 305 aa  65.1  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  21.78 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  20.8 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  32.47 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  20.09 
 
 		 342 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  27.52 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>