27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0149 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  53.95 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  36.77 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  37.33 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  44.25 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  31.2 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  95.1  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  30.8 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  31.94 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  29.67 
 
 		 246 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  31.82 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  36.67 
 
 		 153 aa  85.1  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  36.07 
 
 		 168 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  28.26 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  35.42 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  25.21 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  26.82 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  26.13 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  25.39 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  21.91 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  25.31 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  22.73 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  26.63 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  24.75 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  25.65 
 
 		 308 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>