27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  100 
 
 		 242 aa  490  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  32.72 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  31.62 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  30.19 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  28.64 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  28.26 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  36.19 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  25.58 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  23.89 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  27.06 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  21.19 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  27.69 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  26.6 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  26.83 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  25.38 
 
 		 308 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1294  hypothetical protein  26.72 
 
 		 119 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  26.77 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  25.74 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  26.92 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  32.88 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  19.71 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  28.49 
 
 		 186 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0754  hypothetical protein  25 
 
 		 493 aa  42  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0411737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>