28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0328 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  36.77 
 
 
225 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  42.42 
 
 
224 aa  151  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  34.42 
 
 
216 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  33.63 
 
 
239 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  27.57 
 
 
344 aa  98.2  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  32.71 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  31.53 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  34.51 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  34.5 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  27.78 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  22.29 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  23.08 
 
 
306 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  23.08 
 
 
305 aa  58.5  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  31.69 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  28.64 
 
 
271 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  23.67 
 
 
277 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  22.83 
 
 
342 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  37.97 
 
 
168 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  26.6 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  20.74 
 
 
308 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  28.24 
 
 
175 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  23.18 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  33.78 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  28.18 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  23.85 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>