30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2034 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  40.76 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  31.35 
 
 		 344 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  34.27 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  31.94 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  32.71 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  29.61 
 
 		 246 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  38.73 
 
 		 168 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  34.64 
 
 		 153 aa  87.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  30.19 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  27.56 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  30.53 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  27.69 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  30.19 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  27.83 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  35.47 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  28.18 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  30.99 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  24.68 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  28.43 
 
 		 175 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  21.12 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  24.37 
 
 		 282 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  23.14 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  25.16 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  24.79 
 
 		 319 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1294  hypothetical protein  28.45 
 
 		 119 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  22.75 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>