28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4147 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  77.63 
 
 
153 aa  259  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  31.55 
 
 
239 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  32.23 
 
 
233 aa  101  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  28.8 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  30.39 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  31.19 
 
 
342 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  30.19 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  29.85 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  29.95 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  28.87 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  28.1 
 
 
277 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  32.22 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  26.6 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5960  hypothetical protein  40.17 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464133  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  34.5 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  26.03 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  28.96 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0711  protein of unknown function DUF1526  28.76 
 
 
186 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.691708  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  26.06 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  26 
 
 
305 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1589  hypothetical protein  41.18 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.087195 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  26.63 
 
 
308 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03460  hypothetical protein  29.73 
 
 
146 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  26.83 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  26.37 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0497  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  42  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>