11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1294 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1294  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  254  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  28.32 
 
 
239 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4932  hypothetical protein  30.09 
 
 
225 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0822637  normal  0.441175 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  26.61 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1588  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0832475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  26.72 
 
 
242 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  24.77 
 
 
344 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  28.45 
 
 
220 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  28.07 
 
 
233 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  24 
 
 
255 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5030  hypothetical protein  22.31 
 
 
164 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.229828  normal  0.7799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>