94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2636 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2636  transposase family protein  100 
 
 		 92 aa  190  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2731  transposase family protein  64.77 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0145  transposase family protein  50 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4482  transposase family protein  55.93 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584954  hitchhiker  0.00016401 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2544  transposase family protein  46.05 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1351  transposase family protein  44.74 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1366  transposase family protein  44.74 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1384  transposase family protein  44.74 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1074  transposase family protein  46.05 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0610738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0614  transposase family protein  46.05 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8018  transposase  37.36 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8080  transposase  37.36 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8104  transposase  37.36 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272838  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8258  transposase  37.36 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8291  transposase  37.36 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4057  putative transposase  34.83 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0638006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1808  transposase-like protein  30.77 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00181251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0007  hypothetical protein  42.65 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1019  transposase-like protein  30.77 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.42618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3061  hypothetical protein  34.15 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.637031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2041  hypothetical protein  34.48 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2186  putative transposase  42.03 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2596  transposase IS630  32.58 
 
 		 352 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2875  hypothetical protein  32.97 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1805  ISSod10, transposase OrfB  36.56 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6883  putative transposase  37.63 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5622  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.318804 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5479  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.48 
 
 		 353 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.624312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1909  ISSod10, transposase OrfB  37.63 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.753374 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2575  ISSod10, transposase OrfB  37.63 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0505521  decreased coverage  0.000120768 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8606  putative transposase  41.33 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1841  transposase IS630  29.67 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5569  ISSod10, transposase OrfB  37.63 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0312  transposase IS630  29.67 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.292075  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1261  transposase IS630  29.67 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0659799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2362  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3356  transposase  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00274961  normal  0.454158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2738  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261651  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2735  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0929513 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0201  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213338  normal  0.356281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0343  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0652  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0932  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.413618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0934  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.32183 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1441  transposase IS630  29.67 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0871035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1716  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1722  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.573415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1725  transposase  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1731  transposase  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2729  transposase IS630  31.87 
 
 		 352 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379851  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3951  hypothetical protein  27.5 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4565  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1344  putative transposase  26.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3195  putative transposase  26.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1361  putative transposase  26.6 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7815  putative transposase  37.29 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00323  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0371  hypothetical protein  27.5 
 
 		 356 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03715  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4750  putative transposase  65.52 
 
 		 93 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00188  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00190  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00192  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00319  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00321  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00475  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01801  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00370  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0472  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51442  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4613  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.78154  normal  0.630347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3189  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.734376  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2556  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2181  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1605  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.661033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1205  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.990092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1173  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00431358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0129  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0157  hypothetical protein  35.63 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0221  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0254  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.552682  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0038  hypothetical protein  35.63 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.422937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02171  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0674  ISSod10, transposase OrfB  28.87 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00372  transposase  32.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01017  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01036  hypothetical protein  32.31 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3115  hypothetical protein  33.73 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2003  ISSod10, transposase OrfB  30.11 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3794  ISSod10, transposase OrfB  28.87 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000142272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0001  putative transposase  25.53 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.260077 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2700  putative transposase  25.53 
 
 		 198 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.052317  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0672  ISSod10, transposase OrfB  28.87 
 
 		 177 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00023725  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1557  ISSod10, transposase OrfB  28.87 
 
 		 177 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1559  ISSod10, transposase OrfB  28.87 
 
 		 177 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>