63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0198 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  79.28 
 
 		 277 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  79.68 
 
 		 278 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  69.64 
 
 		 265 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  66.14 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  64.63 
 
 		 246 aa  349  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  71.68 
 
 		 251 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  52.49 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  52.53 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  50.45 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  48.88 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  41.06 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  46.01 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  40.09 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  40.09 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  37.66 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  43.11 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  38.53 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  39.67 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  40.74 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  36.67 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  42.79 
 
 		 233 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  40.62 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  41.67 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  38.17 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  38.17 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  40.88 
 
 		 363 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  34.4 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  37.62 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  38.5 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  38.92 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  34.86 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  34.86 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  38.14 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  36.21 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  36.76 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  37.22 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  38.82 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  37.29 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  35.84 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  29.6 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  36.67 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  36.14 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  37.07 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  35.09 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  35.68 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  31.28 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  31.28 
 
 		 281 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  30.46 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  47.37 
 
 		 160 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  31.43 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  30.41 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  30.41 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  30.41 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  30.41 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  30.41 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  30.41 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  29.69 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  28.33 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  30.06 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  32.62 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  33.14 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>