63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0526 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  80.95 
 
 		 277 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  79.68 
 
 		 251 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  73.47 
 
 		 265 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  69.17 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  69.87 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  73.89 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  54.95 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  54.22 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  48.21 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  47.53 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  41.53 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  46.26 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  44.25 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  36.32 
 
 		 246 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  35.47 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  35.98 
 
 		 262 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  37.16 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  42.63 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  36.25 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  41.39 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  39.26 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  40.74 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  45.16 
 
 		 233 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  40.33 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  40.33 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  36.53 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  36.53 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  40.34 
 
 		 242 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  37.96 
 
 		 208 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  34.48 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  38.1 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  34.68 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  39.59 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  37.93 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  38.42 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  34.5 
 
 		 246 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  37.79 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  32.92 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  36.07 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  37.29 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  34.41 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  31.75 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  37.2 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  35.12 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  30.46 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  33.93 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  29.33 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  29.89 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  38.17 
 
 		 160 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  31.55 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  35.43 
 
 		 303 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  35.43 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  33.15 
 
 		 259 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  28.49 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  28.49 
 
 		 281 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  31.28 
 
 		 261 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  38.74 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>