63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5616 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  56.14 
 
 
230 aa  263  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  53.78 
 
 
239 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  51.28 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  49.78 
 
 
255 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  40.35 
 
 
234 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  45.91 
 
 
249 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  38.32 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  38.69 
 
 
246 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  44.02 
 
 
233 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  38.12 
 
 
246 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  37.44 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  40.49 
 
 
253 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  41.63 
 
 
208 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  41.83 
 
 
211 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  36.96 
 
 
246 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  35.89 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  39.34 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  40.71 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  37.04 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  42.44 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  41.24 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  38.16 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  40.49 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  35.32 
 
 
249 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  40.1 
 
 
278 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  34.41 
 
 
248 aa  122  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  39.64 
 
 
244 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  34.69 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  36.16 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  36.1 
 
 
278 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  38.38 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  38.54 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  38.46 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  38.6 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  39.42 
 
 
235 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  39.42 
 
 
235 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  37.21 
 
 
244 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  47.37 
 
 
160 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  32.23 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  34.65 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  36.32 
 
 
251 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  31.55 
 
 
246 aa  106  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  36.59 
 
 
248 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  34.69 
 
 
271 aa  101  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  36.02 
 
 
295 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  35.87 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  37.93 
 
 
238 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  34 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  32.86 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  32.97 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  32.49 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  32.97 
 
 
272 aa  95.1  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  48.19 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  33.17 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  29.35 
 
 
281 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  32.81 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  36.96 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  36.96 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  36.96 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  36.96 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  36.41 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  36.41 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>