63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4300 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  724    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  40.62 
 
 		 233 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  48.55 
 
 		 234 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  46.74 
 
 		 235 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  41.52 
 
 		 208 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  47.49 
 
 		 252 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  45.86 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  45.86 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  41.55 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  43.68 
 
 		 249 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  38.98 
 
 		 246 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  38.98 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  40.58 
 
 		 244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  37.86 
 
 		 246 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  42.86 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  41.71 
 
 		 246 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  39.33 
 
 		 277 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  43.89 
 
 		 242 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  40.88 
 
 		 251 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  39.04 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  38.03 
 
 		 272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  34.48 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  38.38 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  41.99 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  38.59 
 
 		 251 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  38.67 
 
 		 258 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  38.12 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  39.2 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  37.83 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  35.19 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  39.11 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  37.13 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  31.11 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  39.77 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  36.41 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  35.5 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  37.91 
 
 		 255 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  42.2 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  35.82 
 
 		 253 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  35.09 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  34.09 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  39.67 
 
 		 236 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  34.42 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  52.88 
 
 		 160 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  35.26 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  35.38 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  36.46 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  33.33 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  33.68 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  33.66 
 
 		 248 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  39.29 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  39.29 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  39.29 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  39.29 
 
 		 274 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  39.29 
 
 		 274 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  39.29 
 
 		 274 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  31.53 
 
 		 281 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  32.63 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  46.07 
 
 		 238 aa  93.2  6e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  45.35 
 
 		 295 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  30.36 
 
 		 256 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 267 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  32.95 
 
 		 261 aa  89.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>