63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0269 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  41.96 
 
 
256 aa  225  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  41.37 
 
 
285 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  40.67 
 
 
271 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  42.95 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  39.93 
 
 
238 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  34.12 
 
 
261 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  42.39 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  40 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  37.07 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  35.75 
 
 
267 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  37 
 
 
239 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  38.12 
 
 
230 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  37.37 
 
 
242 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  32.38 
 
 
281 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  32.65 
 
 
246 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  35.53 
 
 
277 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  35.2 
 
 
274 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  35.2 
 
 
274 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  35.2 
 
 
274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  35.2 
 
 
274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  35.2 
 
 
274 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  35.2 
 
 
303 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  35.12 
 
 
235 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  36.42 
 
 
249 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  35.09 
 
 
251 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  35.06 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  37.5 
 
 
262 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  40 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  34.53 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  36.61 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  33.73 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  47.87 
 
 
244 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  31.8 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  32.22 
 
 
265 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  30.54 
 
 
234 aa  95.9  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  33.93 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  48.24 
 
 
208 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  36.16 
 
 
236 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  31.79 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  45.35 
 
 
363 aa  92.4  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  46.81 
 
 
255 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  48.19 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  34.39 
 
 
246 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  31.36 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  33.33 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  32.75 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  32.75 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  48.31 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  32.94 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  33.91 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  47.73 
 
 
242 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  33.93 
 
 
246 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  30.94 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  37.5 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  47.73 
 
 
160 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  37.5 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  45.12 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  38.37 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  33.72 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>