63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3737 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  95.53 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  61.02 
 
 		 262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  53.14 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  43.26 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  39.75 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  39.91 
 
 		 244 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  39.91 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  40.09 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  37.79 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  42.25 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  38.22 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  36.32 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  35.47 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  39.11 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  34.03 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  32.75 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  36.74 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  35.65 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  36.82 
 
 		 230 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  37.7 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  35.62 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  33.19 
 
 		 246 aa  138  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  38.98 
 
 		 363 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  39.39 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  34.39 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  36.27 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  35.89 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  38.03 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  37.37 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  37.66 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  39.56 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  38.69 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  39.07 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  39.07 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  32.44 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  35.57 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  38.59 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  35.27 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  35.45 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  29.64 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  36.46 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  36.36 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  30.65 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  36.65 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  31.68 
 
 		 285 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  28.86 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  28.45 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  33.13 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  47.31 
 
 		 160 aa  92.8  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  33.13 
 
 		 274 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  34.39 
 
 		 295 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  25.97 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  31.25 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  39 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  31.47 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  46.84 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  28.34 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  40.96 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>