65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1398 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1398  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1403  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0668  hypothetical protein  99.64 
 
 
274 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.549545  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1199  hypothetical protein  99.64 
 
 
274 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3087  hypothetical protein  99.64 
 
 
274 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1531  hypothetical protein  99.27 
 
 
303 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.782336  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2668  protein of unknown function DUF1223  50.56 
 
 
281 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2842  hypothetical protein  90.07 
 
 
265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1589  hypothetical protein  44.61 
 
 
267 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.468458  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2541  hypothetical protein  36.98 
 
 
259 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.255646  hitchhiker  0.0076728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0302  hypothetical protein  39.46 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.609493  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4003  hypothetical protein  32.75 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3896  hypothetical protein  34.48 
 
 
248 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  0.0332964 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0465  hypothetical protein  35.87 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3831  uncharacterized secreted protein  36.11 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0309  hypothetical protein  34.46 
 
 
285 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0403  hypothetical protein  35.56 
 
 
256 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3734  protein of unknown function DUF1223  37.82 
 
 
277 aa  108  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.728831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3635  hypothetical protein  33.89 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3618  protein of unknown function DUF1223  37.06 
 
 
262 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.087325  hitchhiker  0.000138491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0269  hypothetical protein  33.82 
 
 
295 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397963 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4300  hypothetical protein  41.07 
 
 
363 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1007  hypothetical protein  36.02 
 
 
208 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5424  protein of unknown function DUF1223  39.33 
 
 
258 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0189201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0453  hypothetical protein  36 
 
 
235 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3315  uncharacterized secreted protein  34.76 
 
 
238 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1807  hypothetical protein  36 
 
 
235 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2644  hypothetical protein  37.99 
 
 
233 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  0.0243204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3082  hypothetical protein  34.86 
 
 
262 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0203  hypothetical protein  34.22 
 
 
251 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1850  hypothetical protein DUF1223  33.82 
 
 
234 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.78022  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2529  protein of unknown function DUF1223  32.44 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5140  protein of unknown function DUF1223  37.5 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0198  protein of unknown function DUF1223  31.58 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3737  protein of unknown function DUF1223  33.13 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0103  hypothetical protein  30.35 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4986  hypothetical protein  41.48 
 
 
239 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.291718  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1401  hypothetical protein  38.37 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00664299  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0383  hypothetical protein  36.26 
 
 
246 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0526  hypothetical protein  36 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680499  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0324  hypothetical protein  33.53 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0407  hypothetical protein  33.14 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3356  hypothetical protein  34.68 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4060  protein of unknown function DUF1223  31.93 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0290  hypothetical protein  31.58 
 
 
277 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838971  normal  0.0132411 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5436  protein of unknown function DUF1223  35.88 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000960294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1860  protein of unknown function DUF1223  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1385  hypothetical protein  38.95 
 
 
242 aa  90.1  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3851  hypothetical protein  34.88 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13148  hypothetical protein  26.57 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0172968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4862  hypothetical protein  35.47 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5501  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4186  hypothetical protein  34.18 
 
 
262 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4991  hypothetical protein  37.13 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3483  hypothetical protein  34.43 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4245  protein of unknown function DUF1223  30.26 
 
 
242 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5616  hypothetical protein  50.57 
 
 
236 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.339689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0882  hypothetical protein  36.65 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.618789  hitchhiker  0.00259395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3065  hypothetical protein  34.46 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0089  hypothetical protein  36.21 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0091  hypothetical protein  41.3 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5055  hypothetical protein  47.67 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2862  hypothetical protein  34.08 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0440719  normal  0.608051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3696  hypothetical protein  45.35 
 
 
160 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1228  protein of unknown function DUF1223  33.85 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00906939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  26.44 
 
 
405 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>