More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6063 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6063  plasmid partitioning ATPase ParA  100 
 
 		 374 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.258105 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0009  ParaA family ATPase  49.87 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  27.87 
 
 		 258 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.28 
 
 		 265 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.98 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03139  hypothetical protein  25.62 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002837  SOJ-like and chromosome partitioning protein  27.13 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.69 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0438  putative CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  24.47 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.132493  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7204  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.442713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1968  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.68 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0078  partitioning protein, ParA  28.05 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.980014  hitchhiker  0.00231687 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1116  chromosome partitioning ATPase  24.55 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.897501  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.92 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.05 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.78 
 
 		 264 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.57 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.35 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.64 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.09 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  28.5 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.18 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  28.57 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.46 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.199192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1490  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.81 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.630454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  28.95 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4218  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 452 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0067  plasmid partition protein A  28.84 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.8 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0722  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.56 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.07 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8198  replication protein A  28.8 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3591  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.13 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.46 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0035  putative protein sopA  28.84 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  24.64 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.17 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.01 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0009  plasmid-partitioning protein SopA  27.17 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0766545 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  27.73 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0183804  normal  0.0975853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.29 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.74 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.65 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  28.57 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  22.97 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  27 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.64 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.66 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.05 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  24.42 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  27 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.67 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.14 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  26.64 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0007  plasmid-partitioning protein SopA  27.15 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.29 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.67 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  25.38 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.82 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.58 
 
 		 250 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  23.23 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.34 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.43 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.71944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  24.9 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0930  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.03 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.86 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.04 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4250  plasmid-partitioning protein SopA  27.14 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.100676 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5035  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  24.65 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1369  putative ParA-like partition protein  32.62 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4242  hypothetical protein  27.98 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  29.63 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.73 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  26.62 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.76 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.51 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.07 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6162  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  24.55 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.8 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  22.7 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1454  chromosome partitioning protein  24.14 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>