153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1629 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  100 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5105  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  80.62 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2152  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  58.13 
 
 		 162 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0032  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  54.09 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.630723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1775  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  52.17 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3485  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  49.38 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4209  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  46.54 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176397  normal  0.786094 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01291  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09754)  45.28 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0163  hypothetical protein  28.89 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.62 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1582  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.81 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.625923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  32.48 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4439  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.23 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  35.42 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  27.7 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1480  hypothetical protein  31.3 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.412839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0164  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.86 
 
 		 133 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.09 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.46 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  27.74 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  34.75 
 
 		 131 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0148  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0166  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.11 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.996631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.46 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3121  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.92 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.540481  normal  0.0305982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2194  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.25 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.05 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.08 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0499  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1447  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.5 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.724218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1035  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.11 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.115298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1482  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.08 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  28.21 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1877  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.44 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.798516 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.45 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09880  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1907  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.39902  hitchhiker  0.0000265119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7165  hypothetical protein  33.9 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  29.31 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  26.5 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  35.19 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0424  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.77 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155822  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2315  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.14 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.08295  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  28.45 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.26 
 
 		 140 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07594  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15290)  30.17 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.651423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2568  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.36 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  33.83 
 
 		 130 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  25.64 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0199  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.73 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0030  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.78 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378297  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2242  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.41 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.59 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.93 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0737  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  34.65 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.874476  normal  0.0395999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.94 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4618  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.67 
 
 		 133 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3468  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.99 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3558  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.52 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.45 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1182  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0852446  normal  0.729931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2294  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  34.19 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.83 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1412  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.43 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233929  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0438  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  36.26 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0694453  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  33.04 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0696  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.45 
 
 		 136 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3405  hypothetical protein  31.76 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.45 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.45 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0968  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.46 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.4173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.09 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.6 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  47.22 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2237  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  30.37 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.45 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.17 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.5 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6263  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1872  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.79 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308799  normal  0.266462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4350  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.69 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.300431 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3339  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.09 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0854  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.96 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.89 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.18 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.84 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5079  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.44 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00555698 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0590  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.09 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0714  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.47 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0716  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.36 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  0.559359 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>