110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3485 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3485  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  100 
 
 		 163 aa  340  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2152  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  60 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.740142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0032  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  59.51 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.630723  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1775  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  53.12 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5105  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  52.5 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113344  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4209  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  47.5 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176397  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1629  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  49.38 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01291  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09754)  33.33 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04936  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1776  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.621397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2174  hypothetical protein  32.06 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3563  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1698  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.33 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0579  hypothetical protein  27.21 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2421  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0884  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.9 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2864  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.17 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2353  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.17 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0739  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.71 
 
 		 136 aa  51.2  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0897  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.21 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2224  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  33.03 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.622287  normal  0.335155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0883  hypothetical protein  26.71 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3283  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.71 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2000  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.83 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.385456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3478  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.52 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0575  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.23 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962204  hitchhiker  0.00000348554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1324  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.97 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4439  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.48 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3983  hypothetical protein  29.37 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03450  expressed protein  47.73 
 
 		 104 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0058  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.97 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2367  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.85 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1362  hypothetical protein  25.71 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.98535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3022  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.24 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0780  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.58 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3395  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.03 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2924  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.17 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00417585  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0603  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.61 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.791565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3119  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  23.97 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0861  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.52 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1053  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43799  predicted protein  27.27 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0590  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  29.03 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3388  hypothetical protein  28.81 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0374  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.01 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4581  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.93 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2780  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.58 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2005  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.97 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1676  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.41 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0508744  hitchhiker  0.000321542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3234  hypothetical protein  27.05 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2904  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0409  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3181  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.05 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3220  hypothetical protein  27.05 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0830  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.77 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3109  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.22 
 
 		 141 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1147  hypothetical protein  28.44 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3908  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.23 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2808  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  28.44 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3578  hypothetical protein  29.09 
 
 		 126 aa  44.3  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0728656  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2604  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  31.58 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3013  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.11 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3282  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.72 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1392  hypothetical protein  28.1 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0250  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.97 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29150  hypothetical protein  27.97 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0146992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3511  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.69 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0942  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.18 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.583327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0381  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  27.34 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.543361  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2062  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0030  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  25.85 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378297  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0332  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.13 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.989164  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0815  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  26.13 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1413  hypothetical protein  23.02 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584165  normal  0.0202303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3196  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  32.97 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0849  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2681  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1928  hypothetical protein  26.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4371  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.07 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.732633  normal  0.279445 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1442  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.35 
 
 		 131 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2548  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  32.97 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.947036  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10368  DUF636 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11530)  29.21 
 
 		 141 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0141752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1569  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.43 
 
 		 135 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.46941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0499  hypothetical protein  24.41 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2517  hypothetical protein  30.68 
 
 		 138 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.570745  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0763  hypothetical protein  27.63 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2056  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.7 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.240914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3058  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.32 
 
 		 131 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0784  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  26.13 
 
 		 136 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0987  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.56 
 
 		 137 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3121  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25.83 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.540481  normal  0.0305982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0450  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  30.3 
 
 		 134 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000104305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3020  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  25 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.082898  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0419  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  31.46 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.820444  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2827  putative lipoprotein  24.09 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0331828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1825  glutathione-dependent formaldehyde-activating, GFA  27.52 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.893199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3356  hypothetical protein  27.43 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217164  normal  0.0851639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2912  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  29.55 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0297  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  28.89 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>